Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtaP09225 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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LtaP09225 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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