Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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H2-Ab1P01921 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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H2-Ab1P01921 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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H2-Ab1P01921 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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H2-Ab1P01921 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Ab1P01921 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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