Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01656 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01656 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01656 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01656 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01656 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01656 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01656 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01656 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01656 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01656 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms