Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01654 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01654 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01654 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01654 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01654 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01654 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01654 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01654 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01654 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01654 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms