Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01644 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01644 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01644 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01644 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01644 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01644 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01644 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01644 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01644 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01644 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01644 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01644 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01644 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01644 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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