Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ifnb1P01575 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms