Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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