Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan6O70401 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms