Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms