Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Copb2O55029 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Copb2O55029 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Copb2O55029 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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