Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SlkO54988 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SlkO54988 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SlkO54988 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SlkO54988 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlkO54988 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms