Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Timm44O35857 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Timm44O35857 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Timm44O35857 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Timm44O35857 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Timm44O35857 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Timm44O35857 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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