Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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