Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk2O35491 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk2O35491 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms