Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe40O35185 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe40O35185 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe40O35185 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe40O35185 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe40O35185 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe40O35185 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe40O35185 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe40O35185 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bhlhe40O35185 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bhlhe40O35185 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Bhlhe40O35185 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bhlhe40O35185 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe40O35185 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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