Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms