Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EllO08856 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EllO08856 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EllO08856 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms