Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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