Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec22bO08547 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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