Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp35M0QWN7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms