Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm2056J3QQ02 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm2056J3QQ02 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm2056J3QQ02 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm2056J3QQ02 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm2056J3QQ02 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm2056J3QQ02 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm2056J3QQ02 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm2056J3QQ02 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm2056J3QQ02 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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