Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20877J3QPZ4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms