Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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