Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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