Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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