Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms