Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm21818J3KMS6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21818J3KMS6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm21818J3KMS6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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