Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Taf4bG5E8Z2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Taf4bG5E8Z2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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