Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn20G5E8X0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms