Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Farp1F8VPU2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms