Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm28038F7BCN9 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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