Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8005F6YKY3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms