Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm10378F6XQQ1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm10378F6XQQ1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm10378F6XQQ1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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