Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Tmem156-201ENSMUST00000043352 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3250E9Q1M3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms