Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms