Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms