Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syde2E9PUP1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms