Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tgfbr3lD3YZZ2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms