Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms