Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap58B2RW38 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms