Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn2B2RVW2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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