Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms