Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spocd1B1ASB6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms