Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem238A9JSM3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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