Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint3A7TZF0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms