Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms