Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm6880A3KG45 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm6880A3KG45 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm6880A3KG45 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm6880A3KG45 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms