Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms