Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2al1jA2BFR3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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