Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms